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Libmol.org, Librairie interactive, MinUSc, Scribmol Archives (Protein Explorer, MolUSc) Modes d'emploi: Nouveautés du site : Action d'un anti-inflammatoire, l'ibuprofène, sur la cyclo-oxygénase 1 - Paul PILLOT mar. 10 févr. 2015, 16:50 Insuline humaine - Paul PILLOT lun. 16 sept. 2013, 02:52. Libmol.org est un logiciel de visualisation moléculaire libre et gratuit, à la prise en main aisée pour les élèves, créé par Paul Pillot. Il en existe une version en ligne et une autre téléchargeable. Ses fonctionnalités sont décrites dans cet article : Libmol.org, nouvelle application de visualisation de molécules, alternative à. Visualisation de molécules avec Libmol.org Espace de travail Sélection par éditeur de commande Sélections prédéfinies Le bouton masque ou montre le composant Représentations de la sélection Colorations de la sélection Aide contextuelle (au survol d'une commande) Remarque : la sélection active et ses propriétés apparaissent en bleu Réglages : couleur arrière-plan, plan de coupe. LibMol.org LibMol.org.. LibMol, visualisation de molécules Visualisation de molécules qui rivalise avec RasTop Paul Pillot propose un nouveau logiciel de visualisation de molécules

Librairie de Molécule

  1. libmol.or
  2. Première publication : 08/06/2012 - Dernière mise à jour : 22/10/2012 Contribution réalisée par : Paul PILLOT . Complexe entre l'acétylcholine et un récepteur à l'acétylcholine : l'AchBP muté
  3. Libmol.org, nouvelle application de visualisation de molécules, alternative à RasTop Paul Pillot vient de développer un nouveau logiciel de visualisation de molécules afin d'offrir une alternative moderne, ergonomique et pédagogique au logiciel RasTop
  4. Ouvrir un fichier local : Charger Ouvrir un fichier PDB (code à 4 caractères) : Charge
  5. La structure de l'ADN. Le modèle ci-contre représente une très courte portion d'une molécule d'ADN Afficher le modèl
  6. Article 1-La librairie de modèles moléculaires LibMol est un espace permettant la mutualisation des données, des savoirs et des compétences en relation avec l'utilisation pédagogique des modèles moléculaires.Cette librairie est francophone. Elle comporte : Une banque de modèles moléculaires sélectionnés par des enseignants de SVT, actualisée régulièrement, accompagnée des.

Libmol.org est une application en ligne qui a été conçue pour répondre à un certain nombre de besoins constatés en classe lorsque les élèves (...) Lire la suite. LibMol.org. LibMol.org est un logiciel en ligne conçu pour afficher et traiter des modèles moléculaires dans un contexte d'enseignement. Le logiciel est (...) Lire la suit (présentation avec logiciel LibMol). Un anticorps est une protéine de forme symétrique constituée de 4 chaînes polypeptidiques reliées par des ponts disulfures : deux chaînes lourdes (H pour heavy) et deux chaînes légères (L pour light). On cherche à déterminer différentes caractéristiques moléculaires des anticorps (AC) qui permettraient d'expliquer leur spécificité vis-à. Libmol, comparaison de molécule RASTOP et LIBMOL sont des logiciels libres de visualisation et de traitement de modèles moléculaires en 3D. RASTOP peut être considéré comme un logiciel classique car il est régulièrement utilisé dans les situations d'évaluation de l'examen des ompéten es expérimentales. Pour qu'il permette une vérita le démarhe d'investigation, peu guidée, l'élève doit avoir.

Libmol.org : un nouveau logiciel de visualisation moléculaire; Exposition « L'œil nu » Vivo, entrez en nature . Les commentaires sont fermés. Rechercher dans le site. Search for: Recherche. Prochains événements. Pas d'évènements prévus pour le moment. En bref. Lancement de la 9ème édition de Science Factor 9 juin 2020 ; Banque d'images médicales de SMART Servier Medical Art 25. Aide à la compréhension : système clé/serrure = fixation enzyme/substrat 5- Afficher le logiciel Libmol, à ouvrir sur internet.(Voir fiche technique ci-dessous) 6-En utilisant les fonctionnalités de Libmol, ouvrir en les recherchant : - l'amylase pancréatique porcine en complexe avec des molécules d'amidon • Identifier l'amylase et le fragment d'amidon (glucide) dans le complexe. Libmol.org. 20/11/2017 svt-actus Créé par webmestre. Nouvelles fonctionnalités et fiche technique Le logiciel en ligne Libmol, véritable alternative à Rastop, a évolué depuis quelques mois. Il y a maintenant un exécutable qui fonctionne en local, une ligne de commande avec des suggestions, la possibilité de produire des modèles pour l'impression 3D. Enfin, une fiche technique est. TP1 : action des anti inflammatoires, correction Ø COX (cyclo-oxygénase = enzyme) + Acide arachidonique (substrat) (à prostaglandines, molécules provoquant les symptômes de la réponse inflammatoire : gonflement, rougeur (vasodilatation), chaleur (locale et fièvre), douleur (doc 2 page 298 Proposition de démarche permettant l'utilisation pédagogique des documents proposé

Visualisation multiple avec Libmol

-d'exploiter les fichiers sous libmol pour déterminer la structure de l'anticorps (ou immunoglobuline) en comparant au modèle simplifié de référence ; La structure de l'anticorps. Parties variable et constante de l'extrémité d'un anticorps La zone de liaison anticorps-antigène. L'anticorps est une protéine en forme de Y, formée de quatre chaînes (2 légères et 2 lourdes. tuto libmol , exemple du recepteur de l'ac. This feature is not available right now. Please try again later

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Image obtenue avec Libmol: Des représentations plus anciennes de la protéine. La structure tridimensionnelle des protéines transmembranaires est très difficile à obtenir par cristallographie et résonance magnétique nucléaire. En 2008, dans les cas présentés ci-dessous, la structure avait été obtenue en partant de la structure d'un transporteur ABC bactérien, proche de CFTR. La. Libmol : nouvelle fonction pour analyser les contacts entre les molécules. Eric Jourdan 29 octobre 2018 29 octobre 2018 Actualités, Brèves, Logiciels SVT. Il est maintenant possible de mettre en évidence les résidus qui se trouvent au contact d'une chaîne ou bien d'un autre résidu et de déterminer quelles sont les interactions chimiques au niveau de ce contact. Les applications.

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Bémol : définition, synonymes, citations, traduction dans le dictionnaire de la langue française. Définition : Signe qui baisse la.. 3 - Logiciels Rastop, Libmol, GénieGen et Anagène; Dans la presse; Conférences; Activités ludiques et pédagogiques - Fête de la science ; Qui sommes-nous ? Contacts. École normale supérieure de Lyon Institut français de l'Éducation - ACCES 19 allée de Fontenay 69007 Lyon. Nous contacter par mail . Se tenir informé. RSS d'ACCES; Twitter; Navigation. Thématiques; Biodiversité.

Complexe entre l'acétylcholine et un récepteur à l

Libmol intègre pour cela un mode Séquence qui permet interactivement de faire la relation entre la séquence des chaînes et les résidus qui la constituent. Au survol d'un résidu ou d'une chaîne, son nom s'affiche et il est mis en surbrillance dans la fenêtre de visualisation. Une sélection par clic est possible afin d'appliquer un mode de représentation ou de coloration. Un. TS-tp-p3A-20 Chapitre 2 : L'immunité adaptative, prolongement de l'immunité innée 1 Objectif : comprendre l'immunité adaptative à médiation humorale - caractériser les molécules de l'immunité adaptative L'application en ligne LibMol rencontre déjà un franc succès en cours de sciences. Développé par Paul Pillot, enseignant de SVT au collège international Marie de France de Montréal et testé par plusieurs enseignants, ce logiciel de visualisation moléculaire surprend par sa simplicité d'utilisation, sa rapidité et ses graphismes de qualité Les données de comptages de pollens issus de carottages dans des lacs ou des tourbières permettent de construire des spectres polliniques. Pour cela, un traitement préalable des fichiers est nécessaire

Comment faire réfléchir des collégiens au défi de nourrir l'humanité ? Pour Léonard Ponteri, professeur de SVT au collège REP Frédéric Mistral à Avignon (84) Libmol.org. Molecular visualization made easy for beginners. Web Application. Libmol.org is a single page web application designed to provide students starting structural biology with simplified self explanatory tools to view and interact with biological macromolecules

Rastop ou Libmol (tutoriels ≈ fiches techniques sur internet) Rastop (plus performant) à télécharger/ Limol faisable en ligne - coloration des chaines protéiques (chaque chaine est codée par une séquence d'ADN) - la position de l'antigène fixé permettra de repérer la zone FAB Fichiers ressours en .pdb qui s'ouvrent avec Rastop ou Libmol. Aides techniques : p 365 doc3 et. - Logiciel Libmol (Libmol.org) - Molécules : progestérone et RU486 - Documents 1 et 2 Utilisation de Libmol : Rechercher : progestérone Sélectionner : - Progestérone et son récepteur (monomère) - RU486 en complexe avec le récepteur de la progestérone Commandes : - Tout : boules et bâtonnets / nature - Autres : sphères Problème 2 : Comment concilier sexualité et santé de chacun. - Ouvrir Libmol dans un nouvel onglet du navigateur. (ici la fiche technique) - Télécharger la molécule d'anticorps (clic droit puis enregistrer la cible sous, enregistrer la molécule sur votre bureau ou dans vos documents). - Ouvrir la molécule avec le logiciel en.

Libmol.org, nouvelle application de visualisation de ..

Utilisation du logiciel Rastop ou LibMol - Protocole : Repérer précisément la zone de contact entre l'enzyme et son substrat, en particulier les acides aminés constituant l'enzyme, et les comparer à ceux constituant une enzyme non fonctionnelle. Exemple (modèle choisi) : La. carboxypeptidase (CPA) est une enzyme pancréatique impliquée dans la digestion des chaînes peptidiques. La réaction immunitaire Ch.2: l'immunité adaptative o Au sein d'une région variable il existe des régions hypervariables : ces régions hypervariables sont situées en position 30-35, 48-66, 83-90, 98-112 de la séquence des chaînes lourdes ; elles sont situées e

TP 24 Action des médicaments anti-inflammatoires Matériel envisageable : - fichiers de modélisation moléculaires des complexes : Enzyme COX / acide arachidonique : fichier cox_acide_arachidonique.pdb Enzyme COX / ibuprofène : fichier cox_ibuprofene.pdb Enzyme COX / aspirine» : fichier cox_aspirine.pdb - logiciel de modélisation moléculaire et sa fiche technique : Rastop ou LibMol. FT_Libmol.pdf. FT_Libmol.pdf. Chargement. 0% Télécharg é. L'aperçu nest pas encore disponible, veuillez réessayer ultérieurement. 621,3 ko. Création. Sun Nov 12 15:07:10 CET 2017 par Armelle Vialar. Dernière modification. Sun Nov 12 15:07:10 CET 2017 par Armelle Vialar. Tribu 2019; Conditions générales d'utilisation; Besoin d'aide ? Questions fréquentes; Tutoriels; Nous contacter. Etude de la liaison entre l'anticorps et l'antigène avec le logiciel libmol : - Ouvrir Libmol dans un nouvel onglet du navigateur (ici la fiche technique de libmol)- Rechercher dans la librairie de molécule : anticorps anti-virus de la grippe.Ce fichier présente : l'extrémité d'une chaîne légère et d'une chaîne lourde d'un anticorps (extrémité de l'un des bras courts du Y) et la. Visualisez en 3D des molécules agissant comme des leurres biologiques grâce à Libmol. Protocole : Sur le site libmol.org: Recherchez « la progestérone et son récepteur (monomère) » ; Sélectionnez l'onglet « commande » puis l'onglet « représenter » et sélectionner « rubans ». Comparez avec le RU486 Utilisation de Libmol : Rechercher : progestérone Sélectionner : - Progestérone et son récepteur (dimère) - Progestatif et récepteur à la progestérone Commandes : - Tout : boules et bâtonnets / nature - Autres : sphères Problème 2 : Comment concilier sexualité et santé de chacun ? Ressources : - Documents 2 et 3 Consigne : Répondre aux problèmes 1 et 2 dans un compte-rendu.

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Visualisation de molécules avec Libmol.org Espace de travail Sélection par ligne de commande Sélections prédéfinies Le bouton masque ou montre le composant Représentations de la sélection Colorations de la sélection Aide contextuelle (au survol d'une commande) Remarque : la sélection active et ses propriétés apparaissent en bleu Réglages : couleur arrière plan, plan de coupe. Comment dire LibMol en Français? Prononciation de LibMol à 1 prononciation audio, et de plus pour LibMol

La structure de l'AD

ft_libmol.pdf. ft_libmol.pdf. Liens super-institutionnels. Académie de Toulouse; CNDP; CRDP Toulouse; Ministère de l'éducation nationale; Liens partenaires. Académie de Toulouse; Région Occitanie; Sites pédagogiques; Liens pratiques. Eduscol; Eduthèque; ONISEP; Contacter l'inspection. Rectorat de l'académie de Toulouse . 75 Rue Saint-Roch. 31000 Toulouse. Formulaire de contact. Libmol est un logiciel de visualisation moléculaire libre et gratuit, créé par Paul Pillot. Il en existe une version en ligne et une autre téléchargeable. Application : En ligne, PC Prix : Gratuit Source : Paul Pillot (Logiciel et tutoriel) RasTop Version 2.03. RasTop est un logiciel de visualisation des molécules en 3D, dans la lignée de Rasmol. La version anglaise est accessible. Libmol.org Paul Pillot a développé un outil en ligne pour visualiser et étudier des molécules en 3d. L'interface simplifiée et moderne en fait un successeur de Rastop. Les commandes simplifiées permettent une meilleure autonomie des élèves dans l'étude de molécules. Par exemple, un simple survol sur un élément de la molécule en donne des caractéristiques. Le chargement de la page.

Modèle 3D de la molécule d'actine G visualisé avec le logiciel LibMol. Les atomes sont modélisés par des couleurs : C en gris, O en rouge et N en bleu. 9. Filaments d'actine observés en microscopie à force atomique. Les molécules d'actine G (sphères jaunes) s'associent en longs filaments. TP. Observez d'autres modèles moléculaires avec LibMol Protocole : Aller sur le. Visualisation de molécules avec Libmol.org Espace de travail Sélection par ligne de commande Sélections prédéfinies Le bouton masque ou montre le composant Représentations de la sélection Colorations de la sélection Aide contextuelle (au survol d'une commande) Remarque : la sélection masqués (surbrillance au active et ses propriétés apparaissent en bleu Réglages : couleur. Correction du TPB1 (LOGICIEL LIBMOL) Enzyme COX dont le site actif est mis en évidence (en jaune vert, en sphères). On voit dans ce site actif : - le substrat naturel de l'enzyme, l'acide arachidonique en bleu, image du haut - Ouvrir libmol dans trois onglets différents du navigateur, puis rechercher « progestérone » dans l'onglet 1, « lévonorgestrel » dans l'onglet 2 et « acétate d'ulipristal » dans l'onglet 3. - Mettre les molécules en « boules et bâtonnets » et dans une configuration identique. - Sachant le rôle de la progestérone, expliquer comment le lévonorgestrel et l'acétate d.

Atelier « Structure de l'ADN » : Attention : le logiciel utilise des anciennes données scientifiques : la structure de l'#ADN serait maintenue par des interactions hydrophobes et non par des liaisons hydrogène comme on l'affirmait auparavant (source) Afficher la molécule d'ADN Ouvrir le logiciel LibMol (avec sa fiche technique) Ouvrir « ADN 14 paire A- Remplacement pour l'activité RASTOP : On va travailler avec LibMol: https://libmol.org/ selon la procédure suivante : 1- Dans la barre de recherche, entrer. Libmol permet de basculer simplement d'un affichage fond blanc à un affichage fond noir et de déplacer la molécule ou de zoomer sur celle-ci à l'aide de la souris. L'onglet commande est.

TP 25 Les anticorps : des immunoglobulines spécifiques Matériels : Logiciel Rastop (ou LibMol) avec modèles moléculaires « IGG-TOTAL.pdb », « IGG-LYS.pdb », Fichier IGG-SIDA-3 D : 1E60.pdb, 1NLD.pdb , Fichiers 1ACY.pdb, 1EGJ.pdb, 1F58.pdb Logiciel Anagène avec séquences « IGG sida.4 chaines.edi»; le fichier « igg-vih-8seq.edi) (noté igg-vi~1.edi), Fichier igg-multiples.edi et. Fiche technique Rastop ou Libmol : Consigne 1/ A l'aide des ressources fournies, formuler une hypothèse sur l'effet de la pilule contraceptive sur le fonctionnement de l'appareil reproducteur. Production attendue : Schéma fonctionnel du contrôle du fonctionnement de l'appareil reproducteur sous pilule. Aide pour les groupes en difficulté : fond du schéma demandé Appeler le.

Single Page Web Application for displaying and studying molecular models - rohangro/libmol We'll stop supporting this browser soon. For the best experience please update your browser Tag: Libmol. Un modèle moléculaire simplifié pour étudier la complémentarité lactase-lactose . De Philippe COSENTINO dans la catégorie Devant l'écran, En lycée, Logiciels, Modèles moléculaires; 9 mai 2019. Par Philippe Cosentino La lactase (bêta galactosidase) est un tétramère, ce qui rend complexe son étude en classe. Modèle original : 1JYN (PDB) Nous proposons un modèle. Images obtenues avec Libmol. Les modèles montrent que les mutations ont pour conséquence des structures 3D différentes : sur le récepteur PAV il y a en face extracellulaire une poche au fond de laquelle se trouve l'acide aminé Alanine (en rouge) accessible au PTC, alors que sur le récepteur AVI l'acide aminé Valine (en rouge) est inaccessible au ligand. Les différences de.

Charte d'utilisation de la librairie de molécule

Le polyéthylène (sigle générique PE) [5], ou polyéthène, désigne les polymères d'éthylène.Simples et peu chers à fabriquer, les PE constituent la matière plastique la plus commune, représentant avec 100 millions de tonnes, environ un tiers de l'ensemble des plastiques produits en 2018 [6] et la moitié des emballages.. Le PE qui appartient à la famille des polyoléfines est un. Libmol. Un nouveau logiciel en ligne pour la visualisation et le traitement de données moléculaires dans l'enseignement des SVT. Lire la suite. Mots-clés associés : Application. Contacts. École normale supérieure de Lyon Institut français de l'Éducation - ACCES 19 allée de Fontenay 69007 Lyon. Nous contacter par mail . Se tenir informé. RSS d'ACCES; Twitter; Navigation. Thématiqu

Libmol — Site des ressources d'ACCES pour enseigner la

Explication de quelques unes des fonctionnalités du logiciel Libmol en ligne. Category Education; Show more Show less. Comments are turned off Autoplay When autoplay is enabled, a suggested video. Modèles d'ADN (logiciel LibMol). À gauche, chaque sphère colorée représente un atome. À droite, la couleur grise représente le squelette sucres-phosphates alors que les bâtons bleus symbolisent les bases azotées. 5. La complémentarité des bases. Les couleurs permettent de repérer les différents types de nucléotides. TP. Visualisez l'ADN en 3D avec le logiciel LibMol. Matériel.

Utilser Libmol : (doc, odt, pdf) Visualiser des molécules avec molusc : (doc, odt, pdf) Visualiser des séquences moléculaires avec Jalview : (doc, odt, pdf) Visualiser et créer des molécules avec Avogadro : (doc, odt, pdf) des sites de restriction. Sites de restriction avec anagène 1 : (doc, odt, pdf Libmol.org. visualiser les molécules. Qu'est-ce que c'est ? Paul Pillot vient de développer un nouveau logiciel de visualisation de molécules afin d'offrir une alternative moderne, ergonomique et pédagogique au logiciel RasTop. Quelques usages. Pistes d'usage sur le site SVT de l'académie de Versailles; Visualisation multiple avec Libmol.org ; Comment ça marche ? Plaquette de.

Libmol – SVT – Académie de BesançonADNStructures 3D pour Rastop ou Libmol — Site des ressourcesTS_TP5 : Structure et fonction d'un anticorps - profSVTAtome De Chrome Stock Images - 67 Photos

Libmol, comparaison de molécule

Le TLR2 est un récepteur de type Toll, codé par le gène TLR2 et intervenant dans la reconnaissance bactérienne.. Structure. Le gène est situé sur le chromosome 4 humain.. Le TLR1 s'associe avec le TLR2 pour former un complexe [1] qui se lie aux lipoprotéines bactériennes [2].. Le TLR2 interagit avec les lipoprotéines [3] et les phospholipides oxydés [4].. En médecin La carboxypeptidase (CPA) est une enzyme pancréatique impliquée dans la digestion des chaînes peptidiques. Son substrat est le dipeptide (Gly-Tyr) dont elle catalyse l'hydrolyse pour donne Etude de la structure de l'amylase à partir du logiciel Libmol La version hors ligne du logiciel TP Structure de l'amylase avec Libmol SVT - Baude - Jusserand 2de (Éd. 2019) Liste des ressources Partie 1 L'organisation fonctionnelle du vivant Chapitre 1 Les niveaux d'organisation des êtres vivant

Des gènes au phénotype - Manuel Web BelinRecepteur aux androgène et syndrome d'insensibilité aux

Libmol - SVT - Académie de Besanço

Th3A - la réaction immunitaire Ch.1: la réaction inflammatoire Le mode d'action des anti-inflammatoires Correction Le document 1 montre que la synthèse des prostaglandines est une cascade de réactions - LIBMOL . Cette page permet de rechercher des modèles moléculaires présents dans la banque. Vous pouvez faire une recherche par molécule ou par le thème pédagogique (exemple : étude des protéines). Les logiciels de traitements sont Mollusc, Rastop, Chime... La librairie de molécules a pour but d'améliorer le transfert des connaissances de la recherche vers l'enseignement. Elle. Libmol.org : un nouveau logiciel de visualisation moléculaire. Essys gratuits, aide aux devoirs, cartes-éclair, documents de recherche, rapport de livre, résumés, histoire, sciences, politiqu Vous trouverez ici des liens pour télécharger Regressi et les différents logiciels d'acquisition de données, logiciels libres d'utilisation . Par exemple, on peut demander à l'élève d. cette capsule vidéo présente l'utilisation du logiciel en ligne LIBMOL (logiciel de visualisation moléculaire), à partir de l'exemple de la mise en évidence.

ThLibrairie de molécules - OutilsLes SVT au lycée de l'Elorn

FT_Libmol. FT Rastop. TP 18 Première spé. Chapitre 5 1ere Spécialité Les enzymes. TP 19 Première spé. TP 20 Première spé. TP 21 Première spé. TP 22 Première spé. Chapitre 6 1ere Spécialité Les maladies génétiques. TP 23 Première spé. TP 24 Première spé. TD 25 spé 1ère. TD 26 Première spé. TP 1Spé. TP2 à faire à la maiso II/ Parenté des êtres vivants à l'échelle des molécules A/ Etude de la molécule universelle qui transmet l'information génétique d'une génération à une autre : l'ADN Comment est constitué l'ADN ? Avant la séance : Visualiser la structure de la molécule d'ADN. Repérer les 4 nucléotides (voir p253) et leur règle d'appariement Un dimère de pyrimidine est une lésion moléculaire de l'ADN résultant d'une réaction photochimique entre des résidus de thymine ou de cytosine adjacents [1].La lumière ultraviolette induit la formation de liaisons covalentes par des réactions impliquant les doubles liaisons C=C [2].Dans l'ARN bicaténaire, des dimères d'uracile peuvent également s'accumuler sous l'effet d'un. - Ouvrir Libmol dans un nouvel onglet du navigateur.- choisir dans la librairie de molécule : anticorps anti-virus de la grippe.Ce fichier présente : l'extrémité d'une chaîne légère et d'une chaîne lourde d'un anticorps (extrémité de l'un des bras court du Y) et la molécule d'antigène (fixée à l'anticorps) - Ouvrir Libmol dans un nouvel onglet du navigateur.Télécharger la molécule d'anticorps (clic droit puis enregistrer la cible sous, enregistrer la molécule sur votre bureau ou dans vos documents). - Ouvrir la molécule avec le logiciel. - Afficher la molécule en Boules et bâtonnets.-Identifier le nombre de chaînes en colorant la molécule par chaînes SVT : Libmol une application de visualisation des molécules . Pour visualiser les molécules il y a Rastop. Mais ce logiciel s'avère complexe à utiliser par les élèves. Paul Pillot propose Libmol, un logiciel gratuit. Libmol est une application enligne téléchargeable. Libmol Par fjarraud , le mardi 30 mai 2017. Archives de l'expresso. Voir le forum | Réagir sur le forum | Imprimer.

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